机关单位应当根据涉密信息系统的保密等级和功能，确定系统的密集程度。这主要包括以下几个方面：
1. 保密等级：涉密信息系统的保密等级是决定其密集程度的关键因素。一般来说，保密等级越高，系统的保密性要求越严格，因此需要采取更加严格的措施来确保系统的安全。例如，对于绝密级、机密级和秘密级的信息系统，应当采取不同的安全措施，如物理隔离、访问控制等。
2. 功能需求：涉密信息系统的功能需求也是决定其密集程度的重要因素。如果系统具有高并发、大数据量处理等复杂功能，那么需要采取更复杂的安全措施来保护数据的安全。例如，对于需要处理大量敏感信息的信息系统，应当采用分布式计算、加密传输等技术手段来提高系统的安全性。
3. 网络环境：涉密信息系统的网络环境也是影响其密集程度的一个重要因素。如果网络环境复杂，存在大量的网络攻击和渗透行为，那么就需要采取更为严格的安全措施来保障系统的安全。例如，对于涉及到多个部门、多个单位的信息系统，应当加强网络安全管理，防止外部攻击和内部泄密。
4. 用户权限：涉密信息系统的用户权限也是决定其密集程度的重要因素。不同级别的用户对系统的操作权限不同，因此需要采取不同的安全措施来限制用户的行为。例如，对于需要授权才能访问的系统，应当设置严格的访问控制策略，确保只有授权用户才能访问系统。
5. 系统运维：涉密信息系统的运维工作也是决定其密集程度的因素之一。在运维过程中，需要采取相应的安全措施来保护系统的安全。例如，对于需要定期更新和维护的系统，应当加强运维人员的培训和管理，确保他们能够正确使用系统并遵守安全规定。
总之，机关单位应当根据涉密信息系统的保密等级、功能需求、网络环境、用户权限和运维情况等因素，确定系统的密集程度，并采取相应的安全措施来确保系统的安全。
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