机关单位应当将涉密信息系统部门作为其信息安全管理的核心组成部分。这是因为，随着信息技术的迅猛发展，涉密信息已经成为国家安全和社会稳定的重要保障。因此，机关单位必须高度重视涉密信息系统的管理，将其纳入到日常管理和运行中，确保涉密信息的绝对安全。
首先，涉密信息系统部门是机关单位信息安全管理的关键环节。在机关单位的信息化建设过程中，涉密信息系统的建立和维护是一项重要的工作。涉密信息系统部门负责对涉密信息系统进行规划、建设、维护和管理，确保涉密信息系统的安全运行。这包括制定涉密信息系统的发展战略，组织实施信息系统的建设和优化，以及定期对涉密信息系统进行检查和维护等。
其次，涉密信息系统部门是机关单位信息安全风险防控的关键所在。在信息化时代，信息安全风险无处不在。涉密信息系统部门需要通过建立健全信息安全管理制度，加强对涉密信息系统的风险评估和监测，及时发现和处置各种潜在的安全威胁。同时，还需要加强与外部机构的沟通协作，共同应对信息安全风险。
此外，涉密信息系统部门还是机关单位信息安全应急响应的重要力量。在发生信息安全事件时，涉密信息系统部门需要迅速启动应急预案，组织相关部门和人员进行应急处置，最大限度地减少损失。同时，还需要总结经验教训，完善应急预案，提高应对信息安全事件的能力和水平。
总之，机关单位应当将涉密信息系统部门作为其信息安全管理的核心组成部分。通过建立健全涉密信息系统的管理制度，加强对涉密信息系统的风险评估和监测，以及加强信息安全应急响应能力，可以有效保障涉密信息的绝对安全，为机关单位的稳定和发展提供有力支撑。
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