在软件公司因延迟交付而需要赔偿员工的情况下，公司应当承担相应的赔偿责任。根据《中华人民共和国民法典》第五百七十七条，当事人一方不履行合同义务或者履行合同义务不符合约定的，应当承担继续履行、采取补救措施或者赔偿损失等违约责任。此外，《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律若干问题的解释(四)》第十二条规定了用人单位未及时足额支付劳动报酬的法律后果，包括解除劳动关系、支付经济补偿金等。
在这种情况下，软件公司的赔偿应基于以下原则：
1. 实际损失：公司应根据员工的实际损失进行赔偿，包括工资、奖金、加班费等。如果员工的加班费未得到支付，公司还应支付加班费。如果员工因工作延误而错过晋升或培训机会，公司应提供相应的补偿。
2. 违约金：如果合同中有明确的违约金条款，公司应按合同约定支付违约金。
3. 精神损害赔偿：员工因工作延误而遭受的精神损害，公司应给予适当的精神损害赔偿。
4. 其他损失：员工可能因工作延误而遭受的其他经济损失，如职业发展受阻、家庭关系紧张等，公司也应考虑予以适当赔偿。
在计算赔偿金额时，公司应根据员工的实际损失、劳动合同约定以及当地最低工资标准等因素来确定。同时，公司应确保赔偿金额与员工的过错程度相适应，避免过度赔偿或不足赔偿。
为了维护员工的合法权益，建议公司与员工进行充分沟通，协商确定赔偿方案。如有争议，可寻求专业律师的帮助，通过仲裁或诉讼等方式解决纠纷。
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