在中国，公司以软件著作权出资时需要缴纳增值税和企业所得税。根据《中华人民共和国增值税暂行条例》的规定，纳税人销售货物、提供应税劳务、销售服务、无形资产或者不动产的，应当缴纳增值税。同时，根据《中华人民共和国企业所得税法》的规定，企业以无形资产（包括软件著作权）投资，接受投资方作价入股的，对被投资方来说，其资产转让所得或股利分配所得，应依法缴纳所得税。
具体来说，如果公司以软件著作权作为出资，那么公司在转让该软件著作权时，需要按照以下方式计算增值税：
1. 确定转让价格：公司以软件著作权作为出资，转让价格通常为软件著作权的评估价值。
2. 计算增值税：根据《中华人民共和国增值税暂行条例》的规定，转让无形资产（包括软件著作权）的增值税税率为6%。因此，公司需要按照6%的税率计算增值税。
3. 计算所得税：公司以软件著作权作为出资，接受投资方作价入股的，对被投资方来说，其资产转让所得或股利分配所得，应依法缴纳所得税。具体的所得税税率由国家税务总局规定，通常为25%。因此，公司需要按照25%的税率计算所得税。
4. 计算总税费：公司需要将增值税和所得税相加，得到总税费。
需要注意的是，以上计算方法仅供参考，具体税费计算还需根据相关法律法规和政策进行。同时，公司还需要考虑其他可能产生的税费，如印花税、城建税、教育费附加等。
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