MES系统二次开发主要使用以下几种语言：
1. Java：Java是一种广泛应用于企业级应用开发的编程语言，具有跨平台、面向对象、安全性高等优点。在MES系统中，Java可以用于开发各种模块和服务，如数据库操作、消息通信、界面展示等。
2. C#：C#是微软公司开发的一种面向对象的编程语言，广泛应用于Windows平台上的软件开发。在MES系统中，C#可以用于开发与操作系统紧密集成的模块，如设备控制、数据采集等。
3. Python：Python是一种简单易学的通用编程语言，具有丰富的库和框架，如Django、Flask等。在MES系统中，Python可以用于开发灵活、可扩展的应用，如数据分析、报表生成等。
4. Ruby：Ruby是一种简洁、易读的编程语言，适用于Web开发、游戏开发等领域。在MES系统中，Ruby可以用于开发Web前端、移动应用等。
5. JavaScript：JavaScript是一种主要用于网页开发的脚本语言，具有跨平台、易学易用的特点。在MES系统中，JavaScript可以用于开发与浏览器交互的模块，如用户认证、实时监控等。
6. XML/JSON：这些是用于数据交换和存储的标准格式，常用于MES系统中的数据交换和存储。
7. 数据库：MES系统中需要存储大量的数据，因此需要使用数据库来存储和管理这些数据。常见的数据库有MySQL、Oracle、SQL Server等。
8. Web技术：MES系统通常需要在Web环境下运行，因此需要使用Web技术来开发和维护。常见的Web技术有HTML、CSS、JavaScript、Bootstrap、Vue.js等。
综上所述，MES系统二次开发可以使用多种编程语言和工具，根据具体的项目需求和团队技能选择合适的语言和技术进行开发。
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