电子发票合并后电子签章不见了，可能是由于以下几个原因：
1. 系统设置问题：在电子发票系统中，可能存在一些设置问题导致电子签章无法正常显示。例如，签章权限设置不正确，或者签章模板没有正确加载等。
2. 软件故障：电子发票系统的软件可能出现故障，导致电子签章无法正常显示。这种情况下，可以尝试重启电脑或者重新安装电子发票系统软件，看是否能解决问题。
3. 网络问题：如果电子发票系统需要通过网络进行操作，那么网络问题也可能导致电子签章无法正常显示。例如，网络连接不稳定，或者网络速度过慢等。
4. 文件格式问题：电子发票文件的格式可能与电子发票系统不兼容，导致电子签章无法正常显示。这种情况下，可以尝试将电子发票文件转换为其他格式，看是否能解决问题。
5. 权限问题：如果电子发票系统设置了特定的权限，那么只有具备相应权限的用户才能看到电子签章。这种情况下，可以尝试联系电子发票系统的管理员，看是否能够解决权限问题。
6. 系统升级或更新：有时候，电子发票系统的升级或更新可能会导致一些问题，包括电子签章的消失。这种情况下，可以尝试回滚到之前的系统版本，看是否能解决问题。
7. 人为操作错误：在电子发票系统中，用户可能因为误操作导致电子签章消失。这种情况下，可以尝试重新登录电子发票系统，看是否能解决问题。
总之，电子发票合并后电子签章不见的原因可能有很多，需要根据具体情况进行分析和解决。如果自己无法解决问题，可以联系电子发票系统的技术支持人员寻求帮助。
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