税控开票系统作废电子发票的步骤如下：
1. 登录税控开票系统，进入主界面。
2. 在主界面上找到“发票管理”选项，点击进入。
3. 在发票管理界面上，找到“作废发票”选项，点击进入。
4. 在作废发票界面上，选择需要作废的发票，点击“作废”按钮。
5. 在弹出的对话框中，输入作废原因，然后点击“确定”按钮。
6. 确认作废后，系统会提示操作成功，并显示已作废的发票信息。
7. 如果需要批量作废多张发票，可以按住Ctrl键，同时选中多张发票，然后重复第4-6步的操作。
8. 作废完成后，可以在发票管理界面上查看已作废的发票列表，包括已作废的发票编号、发票号码、开票日期、金额等信息。
9. 如果在作废过程中遇到问题，可以联系税控开票系统的技术支持人员进行咨询和解决。
注意：作废电子发票前，务必确保已经正确保存了原始发票，以免影响后续的报销等业务。同时，作废电子发票后，需要及时通知相关单位和人员，避免造成不必要的损失。
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