根据《中华人民共和国保守国家秘密法》的规定，涉密信息系统的全程管理主要包括以下几个方面：
1. 规划与设计：在系统开发和建设过程中，应充分考虑保密要求，确保系统的安全性和可靠性。同时，应制定详细的设计方案，明确系统的功能、性能、安全措施等，以确保系统的正常运行。
2. 采购与验收：在采购涉密信息系统设备和软件时，应选择具有良好信誉和资质的供应商，确保所购买的设备和软件符合国家保密标准。在验收过程中，应对设备和软件的性能、安全性等方面进行严格检查，确保其满足保密要求。
3. 运行与维护：在系统投入使用后，应建立完善的运行和维护制度，确保系统的安全运行。定期对系统进行巡检、维护和升级，及时发现并处理安全隐患。同时，应加强对系统操作人员的安全教育和培训，提高其保密意识和操作技能。
4. 数据保护：在处理涉密数据时，应采取有效的加密、脱敏等技术手段，确保数据的安全性。对于敏感数据，应实行严格的访问控制，限制非授权人员的访问。同时，应定期备份数据，防止数据丢失或泄露。
5. 应急处理：在发生涉密信息泄露或其他安全事故时，应立即启动应急预案，组织相关人员进行应急处置。及时向上级部门报告情况，配合相关部门开展调查和处置工作。同时，应总结经验教训，完善应急预案，提高应对突发事件的能力。
6. 监督检查：政府部门应加强对涉密信息系统的监督检查，确保各项保密措施得到有效执行。对于违反保密规定的行为，应依法进行处理，严肃追究责任。
7. 法律责任：对于违反保密法规定的行为，依法追究相关责任人的法律责任。对于造成严重后果的，应依法追究刑事责任。
总之，涉密信息系统的全程管理是一项系统性工程，需要从规划设计、采购验收、运行维护、数据保护、应急处理、监督检查和法律责任等多个方面入手，确保系统的安全性和可靠性。
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