制造企业的管理系统费用主要包括以下几个方面：
1. 系统开发费用：这是制造企业管理系统的主要成本之一。这包括了系统的设计、开发、测试和部署等环节的费用。这些费用通常由专业的软件开发公司或团队承担，他们会根据系统的复杂程度、功能需求等因素来确定开发费用。
2. 硬件设备费用：制造企业管理系统需要运行在计算机或其他硬件设备上，因此硬件设备的购置和维护也是一项重要的费用。这包括了服务器、工作站、网络设备、存储设备等硬件的购置费用，以及硬件的维护、升级等费用。
3. 软件许可费用：制造企业管理系统需要使用到一些特定的软件，如数据库管理系统、办公自动化软件、ERP系统等。这些软件的购买和使用都需要支付相应的许可费用。
4. 培训费用：制造企业管理系统的使用需要相关人员进行操作和管理，因此需要对员工进行相关的培训。这包括了培训材料的制作、培训讲师的费用、培训场地的费用等。
5. 维护费用：制造企业管理系统在使用过程中可能会出现各种问题，需要进行维护和修复。这包括了系统的日常维护、故障排查、系统升级等费用。
6. 咨询服务费用：如果制造企业需要专业的咨询和技术支持，那么就需要支付咨询服务费用。这包括了咨询顾问的咨询费、技术支持人员的服务费等。
7. 系统集成费用：如果制造企业需要将多个系统进行集成，那么就需要支付系统集成费用。这包括了系统集成的设计、实施、测试等费用。
8. 数据迁移费用：如果制造企业需要将旧的系统数据迁移到新的系统中，那么就需要支付数据迁移费用。这包括了数据迁移的设计、实施、测试等费用。
9. 项目管理费用：如果制造企业需要外包第三方公司来开发和管理制造企业管理系统，那么就需要支付项目管理费用。这包括了项目管理的人力成本、管理费用等。
10. 其他费用：除了上述主要费用外，还可能有一些其他的费用，如差旅费、会议费、招待费等。
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