企业软件系统工程税目主要包括以下内容：
1. 软件开发成本：包括软件开发人员的薪酬、办公设备、软件许可费、培训费等。
2. 硬件设备成本：包括服务器、存储设备、网络设备、打印机等硬件设备的购置或租赁费用。
3. 系统集成成本：包括软件与硬件的集成、系统集成测试、系统集成维护等费用。
4. 项目管理成本：包括项目管理人员的工资、办公设备、差旅费等。
5. 运营维护成本：包括软件系统的运行维护、升级改造、技术支持等费用。
6. 培训成本：包括对用户进行软件使用培训、提供在线技术支持等费用。
7. 法律和合规成本：包括遵守相关法律法规、行业标准、公司政策等产生的费用。
8. 市场推广成本：包括广告宣传、产品发布会、参加行业展会等活动的费用。
9. 人力资源成本：包括招聘、培训、考核、激励等人力资源管理相关的费用。
10. 财务成本：包括会计、审计、税务等财务管理相关的费用。
11. 其他相关成本：如知识产权费用、合同签订费用、差旅费用等。
企业在进行企业软件系统工程时，需要对这些税目进行详细的预算和规划，以确保项目的顺利进行和成功实施。同时，企业还需要关注税收政策的变化，以便及时调整税务策略，降低税收负担。
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