在中国，软件公司需要缴纳的税种主要包括企业所得税和增值税。以下是具体的计算方法和税率：
1. 企业所得税：根据《中华人民共和国企业所得税法》的规定，企业所得税的税率为25%。对于年利润在100万的软件公司，其应纳税所得额为100万元。因此，其应缴纳的企业所得税为：100万元 * 25% = 25万元。
2. 增值税：根据《中华人民共和国增值税暂行条例》的规定，软件公司销售软件产品时，可以享受增值税优惠政策。根据政策规定，软件公司销售软件产品取得的收入，可以按照3%的税率征收增值税。因此，软件公司年利润100万的情况下，其应缴纳的增值税为：100万元 * 3% = 3万元。
综上所述，软件公司年利润100万的情况下，其应缴纳的税款总额为：企业所得税25万元 + 增值税3万元 = 28万元。
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