在讨论小规模软件公司是否可以开具13%的增值税专用发票时，我们需要从多个角度进行综合分析。
首先，根据《中华人民共和国增值税暂行条例》的规定，小规模纳税人可以自行开具增值税专用发票，并且其税率为3%。这意味着，如果一个小规模软件公司符合小规模纳税人的条件，那么它完全有资格开具13%的增值税专用发票。
然而，实际情况可能会有所不同。在实际操作中，小规模软件公司是否能够开具13%的增值税专用发票，还需要考虑以下几个因素：
1. 公司规模：一般来说，企业规模较大的公司可能更容易获得开票资格。这是因为大型企业通常有更多的资金和资源来满足税务机关的要求，从而更容易获得开票资格。
2. 行业特点：不同行业的税收政策和要求可能存在差异。例如，一些高科技行业或特定领域的软件公司可能更容易获得开票资格。因此，在考虑是否能开具13%的增值税专用发票时，需要了解公司的行业背景和特点。
3. 税务登记情况：企业在税务登记过程中的表现也会影响其开票资格。如果企业在税务登记过程中存在违规行为，如虚开发票、偷税漏税等，那么企业可能无法获得开票资格。
4. 税务机关审核：在实际操作中，税务机关会对企业的开票资格进行审核。如果企业不符合开票条件，即使符合其他条件也可能无法获得开票资格。因此，企业在申请开票资格时需要提供充分的证明材料，以证明其符合开票条件。
综上所述，小规模软件公司可以开具13%的增值税专用发票，但具体能否获得开票资格还需根据实际情况进行判断。在申请开票资格时，企业需要充分了解相关政策和规定，确保自身符合开票条件，以便顺利开展业务。同时，企业还应加强与税务机关的沟通和合作，及时解决可能出现的问题，以确保业务的顺利进行。
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