是的，做MES系统公司需要申请ICP备案。根据中国互联网信息中心的规定，从事互联网信息服务的企业必须向ICP备案机构进行备案，以证明其合法经营并遵守国家法律法规。
ICP备案是指企业在互联网上开展业务活动时，需要向ICP备案机构提交相关材料，包括企业基本信息、网站信息等，以便备案机构对企业经营情况进行审核和监管。通过ICP备案，企业可以确保其在互联网上的业务活动符合国家法律法规要求，避免因违法经营而受到处罚。
对于做MES系统的公司来说，ICP备案是非常重要的。因为MES系统涉及到企业的生产管理和生产过程控制，如果企业没有合法的经营资质和合规的经营行为，就可能导致企业面临法律风险和经济损失。因此，企业在开发和运营MES系统时，必须严格遵守国家法律法规，确保其业务活动的合法性和合规性。
此外，ICP备案还有助于提高企业的信誉和形象。通过ICP备案，企业可以展示其合法经营和合规经营的良好形象，有利于吸引更多的客户和合作伙伴。同时，ICP备案也有助于企业应对政府监管部门的检查和监督，确保企业的经营活动符合国家法律法规的要求。
总之，做MES系统公司需要申请ICP备案，这是为了确保企业的合法经营和合规经营，降低法律风险和经济损失，提高企业的信誉和形象。同时，这也是企业履行社会责任和遵守国家法律法规的重要体现。
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