小程序绑定不同主体的商户进行支付，主要取决于所绑定的商户是否具备相应的支付资质。如果商户已经获得了合法的支付牌照，那么他们就可以正常地在小程序中进行收款。
一般来说，不同的主体可以绑定到同一个小程序上，只要这个小程序本身是合法合规的。但是，如果一个商户想要绑定到另一个没有支付牌照的商户的小程序上，那么这个商户就需要先获得自己的支付牌照。
此外，即使一个商户已经获得了支付牌照，他们也不能随意绑定到其他没有支付牌照的商户的小程序上。这是因为，如果一个商户绑定到其他没有支付牌照的商户的小程序上，那么这个商户就可能会涉及到非法支付的问题。
总的来说，小程序绑定不同主体的商户进行支付，需要确保所有的商户都有合法的支付牌照，并且不能随意绑定到其他没有支付牌照的商户的小程序上。只有这样，才能保证支付的合法性和安全性。
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