当软件开发项目出现违约情况，且项目已经完成90天时，作为合同一方的您可能面临一系列的问题和挑战。以下是一些建议和步骤，帮助您处理这种情况：
1. 评估影响：首先，您需要评估违约对项目的影响。了解违约的具体原因，以及它如何影响了项目的进度、成本和质量。这将帮助您确定下一步的行动方针。
2. 沟通与协商：与您的合作伙伴或客户进行沟通，了解他们的立场和期望。尝试通过协商解决问题，看看是否有可能达成一个双方都能接受的解决方案。
3. 法律咨询：在采取任何行动之前，咨询专业的法律顾问。了解您的权利和义务，以及在这种情况下您可以采取的法律行动。
4. 准备证据：收集所有与项目进度、成本和质量相关的文档和记录，包括合同条款、项目计划、通信记录等。这些证据将在后续的谈判或法律程序中非常重要。
5. 提出索赔：如果协商失败，您可以考虑正式提出索赔。根据合同条款，您可能需要提供详细的计算方法和证据来支持您的索赔请求。
6. 调解或仲裁：如果双方难以达成一致，可以考虑通过第三方调解机构或仲裁庭来解决争议。这些机构通常提供更公正、透明的解决方案。
7. 诉讼：作为最后的手段，您可以考虑通过法院提起诉讼。在法庭上，您需要证明违约行为的存在，以及它对项目造成了实质性的损害。
8. 保护知识产权：确保您的软件产品和相关知识产权得到适当的保护。这可能包括申请专利、商标或版权保护。
9. 监控财务状况：密切关注您的财务状况，确保您有足够的资金来应对可能出现的任何额外费用。
10. 学习经验：无论结果如何，都要从这次经历中吸取教训。分析导致违约的原因，并考虑在未来的项目中如何避免类似问题的发生。
总之，处理软件开发违约的情况需要谨慎和策略性的规划。通过有效的沟通、法律咨询和风险管理，您可以最大限度地减少损失并保护自己的利益。
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