当前电子政务系统建设中存在的问题主要包括以下几个方面：
1. 技术标准不统一：电子政务系统建设过程中，由于缺乏统一的技术标准，导致各地各部门的电子政务系统在功能、数据格式、接口等方面存在差异，给数据的共享和交换带来了困难。
2. 信息安全问题：随着电子政务系统的应用，信息安全问题日益突出。由于电子政务系统涉及大量的敏感信息，如公民个人信息、企业商业秘密等，一旦发生信息泄露或被恶意攻击，将给国家和人民带来巨大的损失。
3. 系统稳定性问题：电子政务系统的建设需要投入大量的人力、物力和财力，但由于技术、管理等多方面的原因，导致系统运行不稳定，经常出现故障，影响政务工作的正常运行。
4. 用户体验问题：电子政务系统的用户界面设计不合理，操作流程复杂，容易导致用户在使用过程中出现困惑，影响政务服务的效率。
5. 法律法规滞后：电子政务系统的建设和应用涉及到许多法律法规，如数据保护法、网络安全法等，但这些法律法规往往滞后于电子政务的发展，无法为电子政务系统的建设提供充分的法律保障。
6. 人才短缺：电子政务系统建设需要具备专业知识和技术能力的人才，但目前我国在这方面的人才培养还相对不足，导致电子政务系统建设的进度受到影响。
7. 资金投入不足：电子政务系统的建设需要大量的资金投入，但由于种种原因，目前我国在电子政务方面的财政投入仍然不足，导致电子政务系统建设的进度受到影响。
8. 公众参与度不高：电子政务系统的建设和运营需要公众的参与和支持，但在实际操作中，公众的参与度不高，导致电子政务系统的效果不佳。
综上所述，当前电子政务系统建设中存在的问题较多，需要政府、企业和社会各界共同努力，加强技术创新，完善法律法规，提高人才培养水平，加大资金投入，提高公众参与度，以推动电子政务系统的健康发展。
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