定制软件开发计入成本费用的科目主要有以下几个：
1. 研发支出：这是企业进行研发活动所发生的费用，包括直接材料、直接人工和制造费用等。在定制软件开发中，这些费用可能包括程序员的工资、办公设备购置费、软件许可费等。
2. 管理费用：这是企业为组织和管理生产经营活动所发生的费用，包括董事会费、咨询费、审计费、诉讼费、技术转让费等。在定制软件开发中，这些费用可能包括项目管理费、技术咨询费、法律服务费等。
3. 销售费用：这是企业销售商品或提供服务所发生的费用，包括广告费、宣传费、展览费、租赁费等。在定制软件开发中，这些费用可能包括市场推广费、客户培训费、售后服务费等。
4. 财务费用：这是企业筹集和使用资金所发生的费用，包括利息支出、汇兑损益等。在定制软件开发中，这些费用可能包括贷款利息、汇率变动损失等。
5. 其他业务成本：这是企业除主营业务外的其他业务所发生的成本，包括投资收益、营业外收入等。在定制软件开发中，这些费用可能包括投资收益、营业外支出等。
6. 生产成本：这是企业生产产品或提供服务所发生的成本，包括直接材料、直接人工和制造费用等。在定制软件开发中，这些费用可能包括硬件采购费、软件授权费等。
7. 无形资产摊销：这是企业无形资产的价值摊销，如专利权、商标权、著作权等。在定制软件开发中，这些费用可能包括软件版权费、专利使用费等。
8. 其他相关费用：这是指企业在特定情况下发生的与定制软件开发相关的费用，如合同违约金、罚款等。
总之，定制软件开发的成本费用需要根据企业的具体情况进行核算，包括直接成本和间接成本，以及与定制软件开发相关的其他费用。在会计处理时，需要将各项费用合理分配到相应的成本科目中，以便准确反映企业的财务状况和经营成果。
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